In de derde aflevering van ' Speel niet met mij, Miss Nagatoro' seizoen 2 of 'Ijiranaide, Nagatoro-san 2nd Attack ’ getiteld ‘Senpai… Were You… Listening to What I Said…?’ Naoto merkt dat Nagatoro per ongeluk zijn mobiel in de clubkamer heeft achtergelaten. Wanneer hij haar klas bezoekt om het terug te geven, verstopt hij zich in het kluisje om Nagatoro's vrienden te ontwijken. Dit blijkt een vreselijke beslissing te zijn, aangezien Hayase hem daar later aantreft en het gevoel heeft dat haar senpai eng was door op zo'n manier naar haar gesprek met haar vrienden te luisteren. Hier is alles wat je moet weten over het einde van 'Don't Toy with Me, Miss Nagatoro' seizoen 2 aflevering 3 of 'Don't Toy with Me, Miss Nagatoro 2nd Attack'. SPOILERS VOORUIT!
Net als elke andere gewone dag hangt Hayase Nagatoro rond met haar senpai in de clubkamer terwijl hij bezig is met tekenen. Dat is wanneer ze een bericht krijgt van haar vrienden die een meisje willen laten praten. Nadat ze is vertrokken, merkt Naoto dat ze haar mobiel op de bank is vergeten en besluit haar te zoeken. Als hij uiteindelijk haar klas vindt, ziet hij Maki en Yoshi naar hem toe lopen. Naoto draait zich om en loopt in de tegenovergestelde richting om te beseffen dat enkele van Nagatoro's vrienden ook uit die richting komen.
Op dat moment realiseert hij zich dat Hayase ook bij hen is en om iedereen te ontwijken verstopt hij zich in het gemeenschappelijke kluisje van een van de klaslokalen. Het blijkt dat hij alle moeite heeft gedaan om uiteindelijk in het klaslokaal van Nagatoro te belanden. Hayase en haar vrienden komen al snel de kamer binnen en beginnen een gesprek te voeren over het soort jongens dat ze leuk vinden. Als Nagotoro eindelijk aan de beurt is, vermeldt ze dat ze liever een jongen heeft met wie ze kan omgaan, wat een toespeling lijkt op haar senpai. Dit schrikt Naoto af, die uiteindelijk net genoeg beweegt om ieders aandacht op het kluisje te vestigen.
Hoewel Hayase geschokt is hem daar aan te treffen, helpt ze hem zonder enige aandacht uit haar klas te komen. Als ze vraagt of Naoto haar antwoord heeft gehoord, rent hij weg, niet in staat Hayase in de ogen te kijken. Later die avond traint Naoto een beetje voor de komende marathon en verdraait hij zijn been een beetje. Hoewel hij zich goed genoeg voelt om de volgende dag mee te doen, lopen de dingen niet zoals verwacht. Terwijl hij met Hayase en haar vrienden rent, merkt hij dat de clubpresident langs hem heen rent in een konijnenjurk.
Naoto weet dat hij niet goed genoeg is om met haar te concurreren en wil het niet eens proberen. Maar Hayase en haar vrienden motiveren hem om het te doen. Helaas is hij zo geblesseerd aan zijn benen dat hij nauwelijks kan lopen. Maar Hayase wil niet dat hij zo gemakkelijk opgeeft en biedt hem een ritje op de rug aan om hem in de competitie te houden. Al snel sluiten haar vrienden zich ook bij haar aan en ze doen hun best om de president te verslaan. Hoewel ze haar uiteindelijk inhalen, wordt Naoto gediskwalificeerd zodra een van de leraren merkt dat hij door anderen wordt gedragen.
Na zijn diskwalificatie in de marathonrace keert Naoto terug naar zijn gewone leven en brengt hij meer tijd door in de clubkamer om aan zijn artistieke vaardigheden te werken. Hij merkt dan echter dat Nagatoro hem al twee dagen achter elkaar niet meer bezoekt, wat vreemd is aangezien ze meestal elke dag met hem omgaat. Naoto begint in paniek te raken omdat ze nu het gevoel heeft dat hij eng is vanwege het locker-incident dat plaatsvond voor de marathon.
Maar toch besluit hij rechtstreeks met haar te gaan praten. Voordat hij bij haar klas komt, komt hij Yoshi en Maki tegen. Ze plagen hem een beetje met Nagatoro en vertellen hem dan dat ze de afgelopen twee dagen verkouden is en daarom niet meer naar school komt. Naoto maakt zich natuurlijk een beetje zorgen om haar. Maki overhandigt hem wiskundeopdrachten zodat hij ze aan Nagatoro kan geven. Later die dag koopt Naoto een cadeau voor zijn vriend en bezoekt hij haar huis.
Maar als niemand aanbelt, maakt hij zich zorgen dat Nagatoro is flauwgevallen. Daarom besluit hij door het raam te gluren, wat een grote vergissing blijkt te zijn. De oudere zus van zijn vrienden, Misaki, maakt een foto van hem en dreigt hem aan te geven bij de politie. Naoto slaagt er gelukkig in haar uit te leggen dat hij Hayase's senpai is, waarna Misaki hem begint te plagen.